Radiant Dawn разделена на четыре части и финал (Endgame), каждая из которых рассказывает историю отдельной армии с собственным набором юнитов, предметов и уровней. Часть 1 — Бригада Рассвета под предводительством Микайи, включающая около 19 юнитов в борьбе за освобождение Дейна. Часть 2 — Королевские рыцари Кримеи под командованием Элинсии, около 17 юнитов в защите королевства. Часть 3 — Наёмники Грейла и Союз Лагуз под руководством Айка, около 25 юнитов в масштабной войне. Часть 4 — объединение всех армий, разделённых на три отряда для штурма Башни Руководства (Tower of Guidance). Юниты, уровни и предметы полностью изолированы между частями до слияния в четвёртой, что создаёт уникальную стратегическую задачу управления тремя отдельными армиями. Переход между частями означает смену перспективы: вчерашние союзники могут стать сегодняшними врагами. Эта структура создаёт эпический масштаб повествования и заставляет игрока развивать юнитов каждой армии параллельно.
