Впервые в основной серии Fire Emblem (за пределами Японии) игрок может выбрать между двумя режимами при начале новой игры. Classic Mode — традиционный режим с перманентной гибелью (Permadeath): если юнит теряет все HP в бою, он погибает навсегда и более недоступен (кроме Chrom и Robin, чья гибель приводит к Game Over). Casual Mode — облегчённый режим: юниты, потерявшие все HP, возвращаются после завершения главы.
Выбор режима фундаментально влияет на стиль игры. В Classic каждый ход требует осторожного планирования, использования Pair Up для защиты хрупких юнитов и готовности к перезагрузке при неудачном стечении обстоятельств. В Casual игрок может позволить себе более рискованные стратегии. Режим выбирается один раз при создании файла сохранения и не может быть изменён впоследствии.
